dpdata.lammps package

Submodules

dpdata.lammps.dump module

exception dpdata.lammps.dump.UnwrapWarning[source]

Bases: UserWarning

dpdata.lammps.dump.box2dumpbox(orig, box)[source]
dpdata.lammps.dump.dumpbox2box(bounds, tilt)[source]
dpdata.lammps.dump.get_atype(lines, type_idx_zero=False)[source]
dpdata.lammps.dump.get_coordtype_and_scalefactor(keys)[source]
dpdata.lammps.dump.get_dumpbox(lines)[source]
dpdata.lammps.dump.get_natoms(lines)[source]
dpdata.lammps.dump.get_natoms_vec(lines)[source]
dpdata.lammps.dump.get_natomtypes(lines)[source]
dpdata.lammps.dump.load_file(fname, begin=0, step=1)[source]
dpdata.lammps.dump.safe_get_posi(lines, cell, orig=array([0., 0., 0.]), unwrap=False)[source]
dpdata.lammps.dump.split_traj(dump_lines)[source]
dpdata.lammps.dump.system_data(lines, type_map=None, type_idx_zero=True, unwrap=False)[source]

dpdata.lammps.lmp module

dpdata.lammps.lmp.box2lmpbox(orig, box)[source]
dpdata.lammps.lmp.from_system_data(system, f_idx=0)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_atoms(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_atype(lines, type_idx_zero=False)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_lmpbox(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_natoms(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_natoms_vec(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_natomtypes(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.get_posi(lines)[source]
dpdata.lammps.lmp.lmpbox2box(lohi, tilt)[source]
dpdata.lammps.lmp.system_data(lines, type_map=None, type_idx_zero=True)[source]
dpdata.lammps.lmp.to_system_data(lines, type_map=None, type_idx_zero=True)[source]